کلونینگ و تعیین خصوصیات ژن های کد کننده ی آنزیم های اسکوالن سنتاز و 3-هیدروکسی3-متیل گلوتاریل کوآنزیم a ردوکتاز، دخیل در فرآیند بیوسنتر مایکوفنولیک اسید در قارچ پنی سیلیوم بروی کامپکتوم
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه اصفهان - دانشکده علوم
- نویسنده مجید لطفی نیا
- استاد راهنما سید صفاعلی فاطمی فاطمی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1389
چکیده
مهندسی مسیرهای متابولیک شامل دستکاری عملکردهای آنزیمی و تنظیمی سلول با کمک روش های dna نوترکیب به منظور افزایش تولید ترکیبات بیوشیمیایی موردنظر می باشد. مایکوفنولیک اسید یک داروی باارزش به منظور سرکوب سامانه ی ایمنی بدن بوده و جزء ترکیبات مروترپنوئیدی است که به طور عمده توسط قارچ هایی مثل پنی سیلیوم بروی کامپکتوم تولید می شود. این ترکیب شامل یک پلی کتید متصل به مولکول فارنسیل دی فسفات (یکی از مشتقات مسیر موالونات) است. اگرچه مایکوفنولیک اسید به طور طبیعی توسط قارچ پنی سیلیوم بروی کامپکتوم تولید می شود، افزایش تولید این ترکیب با استفاده از اصول مهندسی متابولیک یکی از راهکارهای کاهش قیمت تمام شده ی محصول است. با توجه به این که فارنسیل دی فسفات پیش ساز ایزوپرنوئیدی مایکوفنولیک اسید می باشد، افزایش میزان تولید فارنسیل دی فسفات به طور منطقی افزایش تولید مایکوفنولیک اسید را به دنبال خواهد داشت. مرحله ی تعیین کننده ی سرعت واکنش و در واقع گلوگاه مسیر موالونات، مرحله ی احیاء هیدروکسی متیل گلوتاریل کوآنزیم a ((hmg-coa به موالونات می باشد که توسط آنزیم hmg-coa ردوکتاز کاتالیز می شود. بنابراین بیش بیان ژن کدکننده ی این آنزیم از قارچ مورد نظر یکی از اهداف منطقی افزایش تولید مایکوفنولیک اسید می باشد. اخیراً نشان داده شده است که آنزیم های دیگری نیز درکنترل شار کربن به سمت ایزوپرنوئیدهای مختلف در این مسیر دخیل هستند. یکی از این آنزیم ها، آنزیم اسکوالن سنتاز می باشد که اولین مرحله در بیوسنتز کلسترول در پستانداران و ارگوسترول در قارچ ها را کاتالیز می کند. مطالعات بسیاری نشان داده اند که کاهش بیان ژن کدکننده ی آنزیم اسکوالن سنتاز باعث تجمع پیش سازهای لازم برای ساخت متابولیت های ثانویه ی ایزوپرنوئیدی می شود. بنابراین می توان این گونه فرض کرد که کاهش بیان ژن کدکننده ی آنزیم اسکوالن سنتاز باعث تجمع پیش سازی همچون فارنسیل دی فسفات شده و بنابراین باعث افزایش تولید مایکوفنولیک اسید شود. با این حال به علت عدم وجود توالی ژنوم این قارچ، دستکاری این ژن ها درابتدا مستلزم جداسازی ژن های کدکننده ی این دو آنزیم از ژنوم قارچ می باشد. در این تحقیق ژن های کدکننده ی دوآنزیم hmg-coa ردوکتاز واسکوالن سنتاز از قارچ پنی سیلیوم بروی کامپکتوم با روش tail-pcr همسانه سازی و تعیین توالی گردید. این روش پیمایش ژنومی بر اساس pcr، یک روش مناسب برای به دست آوردن نواحی ناشناخته در کنار یک ناحیه ی شناخته شده درون یک ژن می باشد. سپس توالی های مربوط به این دو ژن با استفاده از ابزار بیوانفورماتیک مورد تحلیل قرار گرفت. توالی نوکلئوتیدی dna ژنومی مربوط به ژن sqs اندازه ای معادل 2464 جفت باز داشت. این ژن دارای دو اگزون می باشد و توالی قالب خواندنی باز از نوکلئوتید شماره ی 446 تا نوکلئوتید 1937 می باشد و دم پلی a در ناحیه ی نوکلئوتید 2065 این ژن قرار دارد. همچنین توالی نوکلئوتیدی dna ژنومی مربوط به ژن hmg اندازه ا ی معادل 4304 نوکلئوتید داشت. ژن hmg دارای سه اگزون می باشد وتوالی قالب خواندنی باز این ژن از نوکلئوتید شماره ی 303 تا نوکلئوتید 3319 می باشد و دم پلی a در ناحیه ی نوکلئوتید 3332 این ژن قرار دارد. بررسی های فیلوژنتیکی نشان داد که این توالی های نوکلئوتیدی شباهت بسیار زیادی با ژن های sqs و hmg در سایر قارچ ها دارد. نتایج به دست آمده از این تحقیق راه را برای دستکاری مسیر موالونات در قارچ پنی سیلیوم بروی کامپکتوم به منظور افزایش تولید مایکوفنولیک اسید هموار می سازد.
منابع مشابه
تولید و بهینه سازی مایکوفنولیک اسید با استفاده از قارچ پنی سیلیوم بروی کامپکتوم
مایکوفنولیک اسید به عنوان یکی از داروهای مهم در پزشکی درنقش یک آنتی بیوتیک، ضد قارچ و ضد ویروس قوی مورد استفاده بوده است. این دارو با کاربرد جلوگیری از پس زدن عضو پیوندی در سالیان اخیر مورد تحقیق بسیاری از دانشمندان دنیا قرار گرفته است. در این تحقیق تولید این ماده بوسیله قارچ پنیسیلیوم بروی کامپکتوم در کشت غوطه ور مایع مورد مطالعه قرار گرفته و محیط کشت مایع جهت رشدو تولید مایکوفنولیک اسید توسط ...
15 صفحه اولهمسانه سازی و تعیین خصوصیات ژن های موالونات دی فسفات دکربوکسیلاز (mdd) ایزوپنتنیل پیروفسفات ایزومراز (ipi) و فارنسیل دی فسفات سنتاز (fds)، درگیر در فرآیند بیوسنتز مایکوفنولیک اسید در قارچ پنی سیلیوم بروی کامپکتوم
مایکوفنولیک اسید یکی از متابولیت های ثانویه گونه های مختلف قارچ پنی سیلیوم، به ویژه پنی سیلیوم بروی کامپکتوم می باشد که دارای خواص آنتی بیوتیکی، ضد ویروسی، ضد باکتریایی، ضد توموری و بازدارندگی سیستم ایمنی بدن است. یکی از مشکلات موجود بر سر راه تولید میکربی مایکوفنولیک اسید، بازدهی پایین سویه های تولید کننده این ترکیب می باشد. برای حل این مشکل می توان از روش های مهندسی متابولیک برای شناسایی و دس...
بررسی بیان ژن 3- هیدروکسی 3- متیل گلوتاریل کوآنزیم A ردوکتاز (HMGR)و گاماترپینن سینتاز (TPS2) تحت تنش کمآبی در آویشن باغی (Thymus vulgaris L.)
چکیده این آزمایش با هدف بررسی بیان ژنهای دخیل در مسیر بیوسنتز مونوترپنها و برخی صفات مورفولوژی (شامل وزن تر ریشه و اندام هوایی، ارتفاع بوته، طول ریشه و تعداد ساقه جانبی) در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی با 4 تیمار شامل شرایط 100 درصد (T1، شاهد)، 70درصد (<stro...
متن کاملبررسی وجود ژن کد کننده اسکوالن اپواکسیداز در قارچ درماتوفیت ترایکوفایتون ویولاسئوم
سابقه و هدف: ترایکوفایتون ویولاسئوم یک قارچ درماتوفیت است که پوست، ناخن و موی انسان را مورد تهاجم قرار می دهد. اما مطالعات کمی بر روی زیست شناسی مولکولی این قارچ انجام شده است. این مطالعه با هدف بررسی حضور ژن کد کننده اسکوالن اپواکسیداز در قارچ ترایکوفایتون ویولاسئوم انجام شده است. مواد و روش ها: این مطالعه به صورت مقطعی بر روی قارچ ترایکوفایتون ویولاسئوم جدا شده از بیماران مراجعه کننده به بخش...
متن کاملتولید مایکوفنولیک اسید در محیط کشت جامد با استفاده از سویه های استاندارد پنی سیلیوم برویکامپکتوم
مقدمه: مایکوفنولیک اسید مایکوتوکسینی است که توسط پنی سیلیوم برویکامپکتوم تولید و در صنایع دارویی برای سنتز داروهای سرکوب کننده سیستم ایمنی مورد استفاده قرار می گیرد. هدف این مطالعه آن بود تا با استفاده از سویه های استاندارد پنی سیلیوم برویکامپکتوم امکان تولید آزمایشگاهی مایکوفنولیک اسید با استفاده از محیط کشت جامد را مورد بررسی قرار دهد. روش بررسی: سه سویه استاندارد پنی سیلیوم برویکامپکتوم از ک...
متن کاملبررسی وجود ژن کد کننده اسکوالن اپواکسیداز در قارچ درماتوفیت ترایکوفایتون ویولاسئوم
سابقه و هدف: ترایکوفایتون ویولاسئوم یک قارچ درماتوفیت است که پوست، ناخن و موی انسان را مورد تهاجم قرار می دهد. اما مطالعات کمی بر روی زیست شناسی مولکولی این قارچ انجام شده است. این مطالعه با هدف بررسی حضور ژن کد کننده اسکوالن اپواکسیداز در قارچ ترایکوفایتون ویولاسئوم انجام شده است. مواد و روش ها: این مطالعه به صورت مقطعی بر روی قارچ ترایکوفایتون ویولاسئوم جدا شده از بیماران مراجعه کننده به بخش...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه اصفهان - دانشکده علوم
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023